Bayang gelap dalam perjalanan belajar mengisahkan seorang siswa SMA yang baru pindah sekolah setelah keluar dari pusat rehabilitasi karena gangguan kecemasan. Dia berusaha menyembunyikan masa lalunya dari teman baru, tapi tekanan ujian akhir dan bully dari sekelompok siswa membuat kondisinya kian memparah. Saat catatan rahasianya ditemukan, dia harus memilih antara tetap lari dari masa lalu atau menghadapinya meski tak ada yang percaya padanya. Ujung-ujungnya, rahasia yang selama ini ditutup ternyata mengancam kelulusan seluruh angkatan.